全县森林覆盖率54.58%,草原覆盖率达85%,现有乔木76科85属357种,主要树种有川滇野杉、油麦吊杉、康藏长尾械、扇叶械、桦木、云杉、云南铁杉、松柏、五裂械、高山栎、包石栎、三叶栎、七叶树、华山松、云南松滇青、栓皮栎、麻栎、绿叶石榴、油樟、滇光杨、枫杨、化香、椰树、青香木、木棉、漆树、马槡、弥猴桃、杜鹃、榕树、桃树、李树、苹果、花椒等。竹类有金竹、箭竹、慈竹等。中草药资源有120科800余种。金阳县动物资源丰富,有苏门羚、獐、青猴、金丝猴、猞猁、水獭、小熊猫、金钱豹、芝麻豹、黄猴、岩羊、雉鸠等。